Dosen Fakultas Syariah dan Ekonomi Islam IAIN Ambon hingga januari 2019 telah memiliki 62 orang tenaga pendidik yang terdiri dari 1 orang guru besar, 20 orang doctor, 14 orang calon doktor dan 28 orang Magister dengan berbagai disiplin ilmu yang rinciannya sebagai berikut:
| No | Nama Dosen | Gelar Akademik |
| 1 | Prof. Dr.Abd. Khalik Latuconsina,M.Si | Guru Besar |
| 2 | Dr. Ismail Rumadan, MH | S3 |
| 3 | Dr. Hasan Lauselang, M.Ag | S3 |
| 4 | Dr. Abd. Rauf, M.Ag | S3 |
| 5 | Dr. Mohdar Yanlua, MH | S3 |
| 6 | Dr. Hasbollah Toisuta, M.Ag | S3 |
| 7 | Dr. Husin Anang Kabalmay,MH | S3 |
| 8 | Dr. Mahmud Ishak, M.Ag | S3 |
| 9 | Dra. Aisa Manilet, M.Ag | S3 |
| 10 | Drs. H. Muhammad M., M.Hum | S3 |
| 11 | Dr. Maimuna Toatubun,M.Si | S3 |
| 12 | Dr. H. Rajab, M.Ag | S3 |
| 13 | Dr. Djumadi, M.HI | S3 |
| 14 | Dr. Abd. Jabar Abdul, M.Pd | S3 |
| 15 | Dr. La Jamaa, M.HI | S3 |
| 16 | Dr. M. Ridwan, SH,MH | S3 |
| 17 | Dr. Eka Dahlan Uar, M.Si | S3 |
| 18 | Husin Wattimena, S.Ag,M.Si | S2 |
| 19 | M. Zein Nuhuyanan, S.Ag,M.Si | S2 |
| 20 | Drs. Husen Maswara, M.Th.I | S2 |
| 21 | Dr. Nadhifah Attamimi, S.Ag,M.Si | S2 |
| 22 | Thalhah, MA | S2 |
| 23 | Dr. Roswati Nurdin, M.HI | S2 |
| 24 | Dr. Abubakar Kabakoran,M.Si | S3 |
| 25 | Hasan, M.Ag | S2 |
| 26 | Salma Saimima, MM | S2 |
| 27 | Mar’atun Shalihah, M.Si | S2 |
| 28 | Fitria Karnudu, SE., MM | S2 |
| 29 | Much. Mu’alim,S.HI.,M.HI.,MA | S2 |
| 30 | Dr. Nasaruddin Umar, SH., MH | S3 |
| 31 | M. Taib Honsouw, M.Ag | S2 |
| 32 | Muhammad Hanafi Holle,SE, M.Si | S2 |
| 33 | Dr. Ahmad Lonthor, MH | S2 |
| 34 | Darwis Amin, SE,M.Si | S2 |
| 35 | Fauzia Rahawarin, SH,MH | S2 |
| 36 | St. Syahruni Usman, S.Ag, M.HI | S2 |
| 37 | Tuti Haryanti, SH., MH | S2 |
| 38 | Farid Naya, M.Si | S2 |
| 39 | Syafitri Gani, MH | S2 |
| 40 | Andi Masniati, M.Hum | S2 |
| 41 | Dety Aryani Relubun, M.Si | S2 |
| 42 | Arizal Hamizar, M.Si | S2 |
| 43 | Rosna Kurnia, M.Ak | S2 |
| 44 | Nahriah Latuconsina, M. ESy | S2 |
| 45 | Muammar W. Maruapey, M.M | S2 |
| 46 | Rosita Tehuayo, M. A | S2 |
| 47 | Yusrianti Hanike, M.Si | S2 |
| 48 | Didin Baharuddin, M. Ud | S2 |
| 49 | Ariya Bayu Setiaji, M.Pd | S2 |
| 50 | Harni Kalderak, M.H | S2 |
| 51 | Ismela Tuharea, M.H | S2 |
| 52 | Nur salam, M.Pd | S2 |
| 53 | Syaidah, M.Pd | S2 |
| 54 | Dr. Abubakar Kabakoran, M, Si | S3 |
| 55 | Diar Muzna Tangke, M. Si | S2 |
| 56 | Syah Awaluddin Uar, S. Hi., MH | S2 |
| 57 | M. Umar Kalibia, M.Si | S2 |
| 58 | Sarfan Putuhena, MH | S2 |
| 59 | Abd. Muis Pikahulan, M.H | S2 |
| 60 | Harni Kelderek, M.H | S2 |
| 61 | Abdullah Ely, M.H | S2 |
| 62 | Gazali Rahman, M.H | S2 |
